La conscience et la raison peuvent-elles entrer en conflit ?

Cela n'est pas nécessaire, car peut-être que je suis capable de les produire de moi-même. Moi donc à tout le moins ne suis-je pas quelque chose ? Mais j'ai déjà nié que j'eusse aucun sens ni aucun corps. J'hésite néanmoins, car que s'ensuit-il de là ? Suis-je tellement dépendant du corps et des sens que je ne puisse être sans eux ? Mais je me suis persuadé qu'il n'y avait rien du tout dans le monde, qu'il n'y avait aucun ciel, aucune terre, aucuns esprits, ni aucuns corps; ne me suis-je donc pas aussi persuadé que je n'étais point ? Non certes, j'étais sans doute, si je me suis persuadé, ou seulement si j'ai pensé quelque chose. Mais il y a un je ne sais quel trompeur très puissant et très rusé, qui emploie toute son industrie à me tromper toujours. Il n'y a donc point de doute que je suis, s'il me trompe; et qu'il me trompe tant qu'il voudra, il ne saurait jamais faire que je ne sois rien, tant que je penserai être quelque chose. De sorte qu'après y avoir bien pensé, et avoir soigneusement examiné toutes choses, enfin il faut conclure, et tenir pour constant que cette proposition : Je suis, j'existe, est nécessairement vraie, toutes les fois que je la prononce ou que je la conçois en mon esprit.

On définit communément la conscience comme ce qui accompagne mes gestes et pensées: être conscient signifie que nous sommes à même de rendre compte de ce que nous faisons et parfois pensons. La raison quant à elle semble être cette faculté en nous ou cet organe chargé de la réflexion logique, de la conduite de nos raisonnements. Il apparaît que là où la conscience n'est que l'accompagnatrice de mes pensées, la raison en serait la constructrice, voire la fondatrice quant à la logique et à la clarté de celles-ci. La conscience et la raison peuvent-elles entrer en conflit? Comment ces deux moments de moi-même peuvent-elles ne pas se correspondre, ne pas s'entendre voire entrer en conflit? Quel est le lieu d'émergence d'un tel conflit? Est-ce l'esprit conçu comme entité pensante qui contient en lui deux facultés capables d'entrer en opposition tant au point de vue de l'objet que du sens de ce sur quoi elles s'opposeraient?  Y-a-t-il en nous une dualité qui nous fait raisonner et en même temps prendre conscience de quelque chose d'autre? Tout ne serait donc pas rationnel? Si la raison ne peut "raisonner sur tout" qu'advient-il alors de cet aspect de moi? Ma conscience semble contenir une dimension qui ne se laisse pas appréhender par la raison.